BootIt Next Generation umożliwia użytkownikowi tworzenie oraz zarządzanie partycjami. Doskonale poradzi sobie z tworzeniem, formatowaniem, kopiowaniem, usuwaniem, konwertowaniem oraz ze zmianą rozmiaru partycji. Do tego BootIt umożliwia tworzenie skompresowanych obrazów całych partycji i późniejsze ich odtworzenie.